giovedì 21 gennaio 2021

Sars-Cov-2: la “variante UK”

Da: Cross Words - https://mrzodonato.wordpress.com - Luca Ferretti, Senior Researcher in Statistical Genetics and Pathogen Dynamics, University of Oxford.

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Luca Ferretti presenta il suo nuovo paper “Early Analysis of a potential link between viral load and the N501Y mutation in the SARS-COV-2 spike protein” — come è nato, come si è sviluppato, quali risultati ha raggiunto — con un approfondimento sulla nuova “variante UK” che è molto diversa dalle altre mutazioni già individuate.

Quali sono le caratteristiche di questa mutazione? Quanto è pericolosa? Un aumento della trasmissibilità del 56% come impatterà sulla pandemia? E sui vaccini? Se avessimo eradicato il virus, questo non avrebbe avuto spazio per mutare. Quanto sono state importanti le diverse strategie di gestione della pandemia? 

Qui i link ai papers (alcuni in fase pre-print) che son stati citati:

1) “Early Analysis of a potential link between viral load and the N501Y mutation in the SARS-COV-2 spike protein” https://t.co/UvNhqdPvkN?amp=1 con Luca Ferretti

2) “Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations” https://virological.org/t/preliminary… con Andrew Rambaut

3) “Estimated transmissibility and severity of novel SARS-CoV-2 Variant of Concern 202012/01 in England” https://cmmid.github.io/topics/covid1… con Nick Davies

4) BirminghamUniversity Turnkey “S-variant SARS-CoV-2 is associated with significantly higher viral loads in samples tested by ThermoFisher TaqPath RT-PCR” https://www.medrxiv.org/content/10.11…

5) Gupta Lab Neutralising “Antibodies drive Spike mediated SARS-CoV-2 evasion” https://www.medrxiv.org/content/10.11…

6) Nervtag slides “New evidence on VUI-202012/01 and review of the public health risk assessment” https://khub.net/documents/135939561/…

7) Nextstrain “Genomic epidemiology of novel coronavirus – Europe-focused subsampling” https://nextstrain.org/ncov/ e, in particolare, la nuova variante scoperta in UK si vede chiaramente da questa visualizzazione: https://nextstrain.org/ncov/europe?f_… 

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